Habe das gleiche Problem mit einem 2005er Kangoo: Dach fährt problemlos auf und beim Schließen knattert's.
Zu zweit (einer drückt auf den Schalter, der andere ruckelt und zieht an der vorderen Dachkante) kriegt man das Dach wieder zu.
Vielleicht gibt es einen ebenfalls Betroffenen im Raum Berlin, mit dem man gemeinsam dieses Problem angehen könnte?